春秋战国时期,今曹县境内有楚丘邑(今曹县梁堌堆景山遗址一带)、己氏邑(今曹县安蔡楼镇楚天集一带)、安阳邑(今曹县古营集镇安仁集一带)、左氏邑(今曹县韩集镇堤上范村南,又叫左城)等城邑;
秦,于楚丘邑置成武县;
西汉,于己氏邑置己氏县;
景帝中元六年(公元前144年)分梁国设济阴国,中元七年改为济阴郡,治定陶;
东汉,成武县治迁文亭山左(今成武县城);
北魏孝明帝孝昌三年(527年) ,置西兖州,初治定陶,后移左城,与济阴郡同治;
北周武帝宣政元年(578年),改西兖州为曹州;
北齐,废己氏县;
隋开皇四年(584年),复置己氏县;
开皇六年(586年),己氏县改称楚丘县;析定陶县置济阴县为济阴郡附郭,治左城;
隋大业三年(607年)曹州改为济阴郡。
唐武德四年(621年)复为曹州;
天宝元年(公元742年)改曹州为济阴郡。
乾元元年(公元758年)复为曹州,仍治左城;
宋建中靖国元年(1101),曹州改赐广济军。
崇宁元年(1102年)升曹州为兴仁府。
金天会七年(1129年),改兴仁府济阴郡为曹州,济阴县为兴仁府治所;
大定六年(1166年),省乘氏县入济阴县;
大定八年(1168年),黄河决口,左城圮,曹州和济阴县治迁到乘氏县故城(乘氏县488年即北魏太和十二年建于今菏泽城区);
金朝时期,黄河支流入汳水(汴水)东流,一度成为重要的水运航道,北岸设有驿站码头,人烟辐辏,渐成重镇;
元代,曹州楚丘县置盘石镇(今曹县城区),在盘石镇设巡检、税课等官署,今曹县城始为镇建制;
元延祐年间,建盘石镇学宫;
明洪武元年(1368),省济阴县入曹州;
明洪武二年(1369),曹州州治因水患从其临时驻地安陵(今属牡丹区)迁到楚丘县盘石镇,撤楚丘县入曹州,今曹县城始为州治所;
洪武四年(1371),降曹州为曹县,属济宁府,盘石镇改称曹县城;
洪武十八年(1385年),济宁府降为州,曹县随济宁州改属兖州府;
正统十年(1445年)黄河决堤,于乘氏故城复建曹州,曹县属之,仍属兖州府;
清雍正二年(1724年)升曹州为直隶州;
清雍正十三年(1735年),曹州升为府,以原州治所置菏泽县为府治,曹县属之;
1914年,曹县属岱南道(后改济宁道);
1928年,废道,曹县直属山东省;
1937年,曹县划属山东省第十区行政督察专员公署;
1938年6月,曹县划属山东省第十一区行政督察专员公署;
1948年9月,曹县国民政府解体。
1949年8月,曹县属华北人民政府平原省菏泽专署,
1952年11月30日,撤销平原省,曹县属山东省菏泽专区。
1958年10月,撤销菏泽专区,曹县改属济宁专区。
1959年9月,恢复菏泽专区,曹县复属菏泽。
1967年3月,菏泽专区改为菏泽地区,曹县属菏泽地区。
2000年6月,菏泽地区改为菏泽市,曹县属菏泽市。